本校推動高等教育深耕計畫管考機制流程如圖所示，為使計畫順利且確實執行，在計畫執行過程之內部管考流程說明如下：

1. 各子計畫執行單位

四大面向「面向一：教學創新精進」、「面向二：善盡社會責任」、「面向三：產學合作連結」及「面向四：提升高教公共性」下各子計畫定期填報計畫進度與經費使用狀況，並由各計畫主持人進行內部控管，符合規劃則提送計畫辦公室彙整；若有不符合狀況，則各子計畫主持人必須做計畫內容差異分析與問題研判，再將計畫成果及分析研判結果一併提交計畫辦公室彙整。

2. 計畫辦公室

計畫辦公室根據各子計畫提交之計畫進度、成果報告與經費使用狀況進行審議，審議結果若通過，即提交計畫管考委員會審查；若各子計畫進度、成果報告與經費使用狀況審議不通過，則研議因應對策與修正內容，並擲回各計畫限期修正。

3. 高等教育深耕計畫管考會議

為能確實執行本計畫，本校定期召開高等教育深耕計畫管考會議，由校長、教務主任、學生事務處主任、總務主任、研究發展處主任、圖書資訊中心主任、秘書室主任、人事室主任、主計室主任、教務處教學發展組組長及各子項目計畫負責人一同參與。本校高等教育深耕計畫管考機制圖如圖12。

本校高等教育深耕計畫管考會議主要目的如下：

1. 討論及審核各主軸計畫及各子計畫執行方向與本校教育目標、近、中、長程發展重點及特色之契合性。

2. 監督與檢視本計畫之執行情形，包括計畫進度、成果報告及經費使用狀況，並確實掌握計畫執行進度。

3. 審查各項教學資源設備之購置情形，整合本校各系科、中心教學資源。

4. 定期召開計畫管考會議檢視本計畫之執行成效，隨時檢討以作為改進之依據。

5. 根據第一年計畫執行成效，審議第二年計畫內容。